2017年广东省首株欧洲型猪繁殖与呼吸综合征病毒的分离鉴定及其全基因组特征分析

2017年广东省首株欧洲型猪繁殖与呼吸综合征病毒的分离鉴定及其全基因组特征分析

论文摘要

猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)分为两大基因型:欧洲型(基因Ⅰ型)和北美洲型(基因Ⅱ型),我国主要流行毒株为基因Ⅱ型,基因Ⅰ型很少被报道。本研究于2017年从广东省惠州市流产率较高的某猪场的母猪群中所采集的血样中分离到1株基因Ⅰ型PRRSV,命名为EU-GD-HD株,基因组全长为14 869个核苷酸(nt),除poly(A)尾,这是基因Ⅰ型PRRSV首次在广东省被报道。与欧洲型参考毒株全基因组序列比对分析结果显示,EU-GD-HD毒株与基因Ⅰ型代表株Lelystad virus(LV)的核苷酸序列同源性为85.3%,与福建FJQEU14毒株的核苷酸序列同源性最高,为94.3%,其中GP5蛋白的氨基酸序列同源性为92.6%,且与FJQEU14毒株在Nsp2和GP3蛋白上具有相同的氨基酸缺失。全长基因组和ORF5基因遗传进化树分析显示,EU-GD-HD毒株属于基因Ⅰ型PRRSV,与福建FJQEU14毒株的亲缘关系最近。重组软件分析表明,EU-GD-HD毒株未发生重组。本研究结果表明,欧洲型毒株正在进行潜在的扩散。因此,净化欧洲型PRRSV并加以控制就显得尤为重要。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 样品收集
  •   1.2 主要试剂
  •   1.3 引物设计与合成
  •   1.4 病毒总RNA的提取
  •   1.5 RT-PCR检测
  •   1.6 病毒的分离
  •   1.7 RT-PCR扩增与核苷酸测序
  •   1.8 分离株的全基因组序列比对及遗传进化分析
  •   1.9 重组分析
  • 2 结果
  •   2.1 RT-PCR检测
  •   2.2 病毒的分离及全基因组扩增
  •   2.3 全基因组序列比对分析
  •   2.4 全基因组的遗传进化分析
  •   2.5 分离株Nsp2、ORF3和ORF5基因推导的氨基酸序列分析
  •   2.6 重组分析
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 韩晓亮,韦应芳,孙彦阔,李琪,冀池海,王衡,张桂红

    关键词: 猪繁殖与呼吸综合征病毒,基因型,分离与鉴定,基因组分析

    来源: 中国兽医科学 2019年01期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,畜牧与动物医学

    单位: 华南农业大学兽医学院,广东省动物源性人兽共患病预防与控制重点实验室,广东省兽医临床重大疾病综合防控重点实验室

    基金: 国家重点研发计划项目(2018YFD0501200),国家自然科学基金项目(31872489),现代农业技术产业体系基金项目(CARS-35)

    分类号: S852.651

    DOI: 10.16656/j.issn.1673-4696.2019.0014

    页码: 67-75

    总页数: 9

    文件大小: 2620K

    下载量: 231

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