铁皮石斛Csl基因家族生物信息学及表达分析

论文摘要

通过分析铁皮石斛类纤维素合成酶（cellulase synthase-like, Csl）的氨基酸序列特征,挖掘与多糖合成相关的Csl基因,从而为参与多糖代谢的铁皮石斛Csl蛋白的后续研究提供有力参考。本研究在生物信息学层面,对铁皮石斛21条完整Csl蛋白序列的理化性质、导肽、信号肽、疏水性/亲水性、跨膜结构域、蛋白质高级结构及功能域等进行预测分析,并与拟南芥的Csl蛋白进行了同源比对并构建系统进化树。结果表明,CslD2a/b/c、CslD4、CslG3b为酸性蛋白,其余为碱性蛋白;Leu、Ser、Ala、Phe、Val和Ille等氨基酸是铁皮石斛Csl蛋白的主要氨基酸;铁皮石斛Csl蛋白具有明显的疏水区和亲水区,都存在跨膜结构。蛋白质二级结构的主要元件是α-螺旋、无规则卷曲和延伸链。与拟南芥的进化分析显示,铁皮石斛Csl蛋白基因被分为3大分支,CslA和CslC归为一支,CslB/E/G/H归为一支,CslD归为一支。本研究系统分析了铁皮石斛Csl蛋白的序列特征,可为今后深入研究该蛋白在铁皮石斛多糖代谢上的功能提供参考。

论文目录

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 蔡璨璨,李卿,段承俐,陈东红,刘京晶

关键词: 铁皮石斛,类纤维素合成酶,基因家族,生物信息学

来源: 基因组学与应用生物学 2019年05期

年度: 2019

分类: 基础科学,医药卫生科技,农业科技

专业: 生物学,农作物

单位: 浙江农林大学省部共建亚热带森林培育国家重点实验室,第二军医大学长征医院药材科

基金: 国家自然科学基金项目(81603228,31600259)资助

分类号: S567.239;Q943.2

DOI: 10.13417/j.gab.038.002159

页码: 2159-2166

总页数: 8

文件大小: 1501K

下载量: 272

相关论文文献

• [1].寻踪——中华医学魁宝铁皮石斛原产地[J]. 智慧中国 2015(03)
• [2].铁皮石斛多糖研究概况[J]. 壮瑶药研究季刊 2017(01)
• [3].福清地区铁皮石斛生长动态及其影响因素研究[J]. 农业工程技术 2019(28)
• [4].鲜铁皮石斛功能性饮品及其制备方法[J]. 食品工程 2019(04)
• [5].不同储藏条件下铁皮石斛花中色素类成分的变化规律研究[J]. 中国中药杂志 2020(04)
• [6].关于铁皮石斛提取物及其活性成分毛兰素对人乳腺癌细胞抑制作用的研究[J]. 实用妇科内分泌电子杂志 2019(31)
• [7].鲜铁皮石斛颗粒的质量标准研究[J]. 广东药科大学学报 2020(01)
• [8].仿生铁皮石斛在果树下(无土栽培)栽培应该注意的几个技术性问题[J]. 农业开发与装备 2020(02)
• [9].复方铁皮石斛叶超微粉改善高脂血症小鼠的脂质代谢作用[J]. 现代食品科技 2020(04)
• [10].铁皮石斛花对亲代及子代大鼠睾丸组织和精子质量的影响[J]. 预防医学 2020(05)
• [11].铁皮石斛叶的研究进展[J]. 中国民族民间医药 2020(07)
• [12].高效液相色谱法测定铁皮石斛花中总黄酮的含量[J]. 顺德职业技术学院学报 2020(01)
• [13].铁皮石斛近野生栽培环境监控系统研究[J]. 湖北农业科学 2020(04)
• [14].铁皮石斛花固体饮料工艺初探及功能性物质鉴定[J]. 美食研究 2020(02)
• [15].凝胶渗透色谱联用多角度激光光散射测定铁皮石斛多糖分子量及其分布[J]. 浙江农业科学 2020(06)
• [16].响应面法探究铁皮石斛种子一步成苗[J]. 中药材 2019(11)
• [17].道地药材铁皮石斛和三叶青生产技术[J]. 新农村 2020(06)
• [18].小菇促进铁皮石斛光合作用的转录组分析[J]. 植物生理学报 2020(07)
• [19].铁皮石斛花保湿柔肤水配方工艺优化[J]. 轻工学报 2020(04)
• [20].不同干燥方法对铁皮石斛花黄酮含量和抗氧化活性的影响[J]. 时珍国医国药 2020(03)
• [21].烘干温度对铁皮石斛叶多糖抗氧化活性影响的研究[J]. 粮食与食品工业 2020(04)
• [22].两种铁皮石斛茶制备工艺的比较研究[J]. 江西中医药 2020(08)
• [23].关于铁皮石斛养生面条质量的初步研究[J]. 现代食品 2020(16)
• [24].贵州丹寨:将科技“芯片”注入“三农”工作[J]. 当代农村财经 2020(08)
• [25].铁皮石斛花对孕鼠母体和仔鼠出生前毒性的研究[J]. 预防医学 2020(10)
• [26].乐清：创新引领 融合发展 做大做强铁皮石斛产业[J]. 浙江林业 2020(09)
• [27].铁皮石斛藕粉慕斯制备工艺研究[J]. 农产品加工 2020(19)
• [28].铁皮石斛种苗繁育及栽培技术[J]. 农业与技术 2018(24)
• [29].不同附生基质对铁皮石斛生长与代谢成分含量的影响[J]. 现代农业科技 2018(23)
• [30].铁皮石斛有效成分分析方法研究进展[J]. 产业与科技论坛 2018(24)

标签：铁皮石斛论文;  类纤维素合成酶论文;  基因家族论文;  生物信息学论文;