星星草类萌发素蛋白基因(PutGLP2)的克隆及生物信息学分析

星星草类萌发素蛋白基因(PutGLP2)的克隆及生物信息学分析

论文摘要

类萌发素蛋白是一类种子萌发相关的特异性标记,其在植物生物和非生物胁迫应答过程中起到了重要作用。本研究通过酵母cDNA文库筛选,获得全长为1 065 bp的PutGLP2基因,其5′非翻译区164 bp,开放读码框666 bp,编码221个氨基酸,3′非翻译区235 bp。利用PCR技术,克隆获得PutGLP2的ORF序列。生物信息学分析发现,PutGLP2在氨基端(N端)具有一个跨膜结构域及N端信号肽,预测定位于细胞壁或胞外间质。将PutGLP2与水稻的43种GLP蛋白进行聚类分析,发现PutGLP2属于类萌发素亚家族2成员之一,并与水稻OsGLP1-1相似性最高。本研究将为丰富植物类萌发素蛋白基因信息提供参考。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 植物材料
  •   1.2 基因克隆
  •   1.3 生物信息学分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 PutGLP2基因克隆及序列分析
  •   2.2 PutGLP2生物信息学分析
  •   2.3 星星草PutGLP2与水稻OsGLP聚类分析
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 傅文上,李波,戴绍军,李莹

    关键词: 星星草,类萌发素蛋白,基因克隆,生物信息学分析

    来源: 现代农业科技 2019年16期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,农作物

    单位: 东北林业大学盐碱地生物资源环境研究中心,东北盐碱地植被恢复与重建教育部重点实验室

    基金: 中央高校基本科研业务专项资金资助项目(2572018BS03,2572017ET01)

    分类号: Q943.2;S543.9

    页码: 179-180+184

    总页数: 3

    文件大小: 3456K

    下载量: 87

    相关论文文献

    • [1].生物信息学分析筛选胆管癌新候选基因及其意义[J]. 中国医学前沿杂志(电子版) 2020(07)
    • [2].mmu-miR-3475-3P在心脏发育中的生物信息学分析[J]. 重庆医学 2017(26)
    • [3].基于生物信息学分析结合RT-PCR检测的肝细胞癌组织中miRNA表达变化及意义[J]. 山东医药 2020(01)
    • [4].白假丝酵母菌毒力相关的RAPD条带的克隆及其生物信息学分析[J]. 生物技术 2020(01)
    • [5].生物信息学分析影响胶质母细胞瘤生物学行为的关键基因[J]. 武警医学 2020(04)
    • [6].溃疡性结肠炎及其恶性并发症的生物信息学分析和潜在治疗药物筛选[J]. 上海交通大学学报(医学版) 2020(03)
    • [7].统计学方法在生物信息学分析中的应用[J]. 医学信息学杂志 2020(06)
    • [8].弓形虫微线蛋白25的生物信息学分析及其互作蛋白预测[J]. 中国病原生物学杂志 2020(09)
    • [9].癌症疼痛基因的生物信息学分析及其临床意义[J]. 中国医药指南 2020(28)
    • [10].桃拉病毒基因组的生物信息学分析[J]. 安徽农业科学 2019(08)
    • [11].白假丝酵母菌(Candida albicans)WO-1分泌蛋白质组的生物信息学分析[J]. 沈阳师范大学学报(自然科学版) 2020(05)
    • [12].2001—2010年结直肠癌易感基因的生物信息学分析[J]. 肿瘤防治研究 2013(11)
    • [13].前列腺癌对多西他赛耐药相关基因的生物信息学分析[J]. 临床泌尿外科杂志 2020(07)
    • [14].心脏肌球蛋白结合蛋白C的生物信息学分析[J]. 生物信息学 2016(04)
    • [15].淡色库蚊氨肽酶N基因的克隆及生物信息学分析[J]. 中国人兽共患病学报 2016(03)
    • [16].鱼腥草乙酰辅酶A酰基转移酶基因克隆、表达及生物信息学分析[J]. 中草药 2015(01)
    • [17].女性糖尿病周围神经病变相关基因筛选及生物信息学分析[J]. 海南医学院学报 2020(01)
    • [18].烟草丙酮酸脱羧酶的生物信息学分析[J]. 黑龙江农业科学 2020(02)
    • [19].青岛文昌鱼过氧化氢酶基因的克隆及生物信息学分析[J]. 基因组学与应用生物学 2020(02)
    • [20].hsa-miR-216a-5p的靶基因及调控网络的生物信息学分析[J]. 唐山师范学院学报 2020(03)
    • [21].血管紧张素转化酶2生物信息学分析[J]. 安徽科技学院学报 2020(04)
    • [22].人谷胱甘肽过氧化物酶的生物信息学分析[J]. 北华大学学报(自然科学版) 2016(06)
    • [23].海岛棉一个成花素类似基因的克隆和生物信息学分析[J]. 新疆农业科学 2011(11)
    • [24].牛带绦虫亚洲亚种苹果酸脱氢酶基因的生物信息学分析[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志 2008(03)
    • [25].牛PAI-1基因真核表达载体构建、生物信息学分析及功能初探[J]. 中国畜牧杂志 2020(08)
    • [26].基于高通量芯片对小儿急性髓系白血病的生物信息学分析[J]. 吉林大学学报(医学版) 2020(05)
    • [27].沉默调节因子的生物信息学分析[J]. 黑龙江畜牧兽医 2017(09)
    • [28].转座子的分类与生物信息学分析[J]. 农技服务 2016(08)
    • [29].嗜根考克氏菌双组分信号转导系统的生物信息学分析[J]. 基因组学与应用生物学 2020(08)
    • [30].微小脲原体3-00990的生物信息学分析与原核表达[J]. 重庆医学 2020(21)

    标签:;  ;  ;  ;  

    星星草类萌发素蛋白基因(PutGLP2)的克隆及生物信息学分析
    下载Doc文档

    猜你喜欢