普通烟草RAV家族基因结构与功能分析

普通烟草RAV家族基因结构与功能分析

论文摘要

揭示RAV基因在普通烟草中的表达过程及其在生物和非生物因子胁迫下的作用,对于烟草抗逆育种具有重要意义。采用生物信息学手段和qRT-PCR技术分别对普通烟草RAV家族基因进行生物信息学分析、研究该基因在低温和脱落酸(ABA)诱导下的表达模式。分析发现,与拟南芥RAV基因同源的普通烟草RAV基因序列有6条,且与茄科植物同源关系较近;通过结构组成分析,发现RAV蛋白主要由无规则卷曲、α-螺旋和延伸链组成,该家族基因氨基酸序列基本含有AP2和B3结构域,且两个结构域均具有非常强的保守性;表达模式分析显示,普通烟草RAV基因表达部位呈现出明显的组织特异性,且低温和ABA均能诱导该基因上调表达,表明该基因在烟草响应非生物胁迫中发挥重要作用。

论文目录

  • 1 结果与分析
  •   1.1 系统进化树构建及基因结构分析
  •   1.2 烟草RAV蛋白理化性质分析
  •   1.3 烟草RAV蛋白保守结构域预测及功能结构分析
  •   1.4 逆境胁迫下烟草RAV基因表达分析
  • 2 讨论
  • 3 材料与方法
  •   3.1 实验材料
  •   3.2 数据的获取与分析
  •     3.2.1 基因组数据库的构建
  •     3.2.2 理化性质分析
  •   3.3 多序列比对及系统进化树的构建
  •   3.4 基因蛋白结构预测分析
  •   3.5 烟草RAV基因的表达模式分析
  •     3.5.1 转录组表达分析
  •     3.5.2 RNA提取及反转录
  •     3.5.3 实时定量分析
  • 作者贡献
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 韩林贺,徐同庆,任昂彦,孔英珍

    关键词: 普通烟草,基因家族,结构分析,胁迫,功能分析

    来源: 基因组学与应用生物学 2019年04期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,医药卫生科技,农业科技

    专业: 生物学,农作物

    单位: 中国农业科学院烟草研究所,中国农业科学院研究生院

    基金: 国家科技支撑计划项目(NO.2015BAD15B03-05),国家自然科学基金(NO.31470291,31670302)共同资助

    分类号: S572;Q943.2

    DOI: 10.13417/j.gab.038.001658

    页码: 1658-1665

    总页数: 8

    文件大小: 472K

    下载量: 204

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