2017~2018年山东省H9N2亚型禽流感病毒HA基因的遗传进化分析

2017~2018年山东省H9N2亚型禽流感病毒HA基因的遗传进化分析

论文摘要

为了解山东省H9N2亚型禽流感病毒(AIV)的变异情况,采用RT-PCR技术对24株山东分离株的HA基因进行扩增、测序和遗传进化分析。结果显示:分离株HA基因在遗传进化树中均属于欧亚分支的Y280-like分支,与A/DK/HK/Y280/97的HA基因核苷酸序列相似性为89.1%~90.5%。HA裂解位点均只有一个碱性氨基酸(R),符合低致病性AIV的特征。所有毒株234位受体结合位点均为L(亮氨酸),呈现出典型的人流感病毒受体结合特性。另外,分离株均缺失218~220位糖基化位点且新增313~315位糖基化位点。研究表明,分离毒株HA基因在分子水平上发生了变异,要积极应对低致病性禽流感防控面临的新挑战。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料
  •   1.2 试剂及仪器
  •   1.3 引物设计与合成
  •   1.4 病毒的分离和鉴定
  •   1.5 病毒RNA的提取
  •   1.6 HA基因的RT-PCR扩增
  •   1.7 分离株序列测定与分析
  • 2 结果
  •   2.1 病毒的分离鉴定
  •   2.2 RT-PCR扩增结果
  •   2.3 分离株HA基因核苷酸和氨基酸序列分析
  •   2.4 分离株受体结合位点分析
  •   2.5 分离株HA基因裂解位点分析
  •   2.6 分离株潜在糖基化位点分析
  •   2.7 HA基因遗传进化分析
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 高斌,张帅,魏志鹏,李旭冬,宋存鑫,曾帅,唐熠,刁有祥

    关键词: 禽流感病毒,亚型,基因,遗传进化分析

    来源: 中国家禽 2019年06期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,畜牧与动物医学

    单位: 山东农业大学动物科技学院,山东省动物生物工程与疾病防治重点实验室,山东省畜禽疫病防制工程技术研究中心,山东峪口禽业有限公司

    基金: 泰山产业领军人才项目(LJNY201610)

    分类号: S852.65

    DOI: 10.16372/j.issn.1004-6364.2019.06.005

    页码: 21-26

    总页数: 6

    文件大小: 1145K

    下载量: 163

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