基于iTRAQ技术的天然富硒与非富硒水稻差异蛋白分析

基于iTRAQ技术的天然富硒与非富硒水稻差异蛋白分析

论文摘要

为解析不同基因型水稻次生代谢差异成因及其富硒品质形成的蛋白质机制提供参考。采用同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术对天然富硒与非富硒水稻进行定量蛋白质组学研究,探讨两种基因型水稻蛋白质组表达水平的差异。结果共鉴定到定量蛋白质有3 161个,差异蛋白为401个,其中上调差异蛋白193个,下调蛋白208个,生物信息学分析得出77个目标差异蛋白,主要分成10类:氧化还原酶、转移酶、异构酶、热休克蛋白、裂解酶、水解酶、连接酶、合成酶、微管蛋白、肌动蛋白。分析表明天然富硒水稻的抗应激、抗氧化、活性氧代谢、碳水化合物和氨基酸代谢较非富硒水稻强,但参与淀粉合成途径作用较非富硒水稻弱。CYS和metE可能是导致两种类型水稻氨基酸差异的2种关键蛋白,OsAPx02、CatC、riPHGPX、HSP70和HSP90可能是调节两种类型水稻抗氧化和抗应激作用的蛋白基因。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料与试剂
  •   1.2 仪器与设备
  •   1.3 方法
  •     1.3.1 蛋白提取
  •     1.3.2 蛋白质定量
  •     1.3.3 酶切和除盐
  •     1.3.4 标记和等量混合
  •     1.3.5 High pH C18分组分
  •     1.3.6 蛋白质鉴定和生物信息分析
  •     1.3.7 荧光定量PCR(qPCR)验证
  • 2 结果与分析
  •   2.1 质谱鉴定结果
  •   2.2 生物信息学分析
  •     2.2.1 GO注释
  •     2.2.2 COG注释
  •     2.2.3 Pathway代谢通路注释
  •     2.2.5 筛选蛋白的信息
  •   2.3 差异基因的qPCR验证
  • 3 讨论
  • 4 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 曾睿,张果,郑腾达,粟阳,叶小英,贾晓梅,朱建清

    关键词: 水稻,天然富硒,非富硒,蛋白质组学

    来源: 中国粮油学报 2019年11期

    年度: 2019

    分类: 工程科技Ⅰ辑,农业科技

    专业: 轻工业手工业,农作物

    单位: 四川农业大学水稻研究所,都江堰市农业农村局,成都农业科技职业学院

    基金: 四川省国际合作与交流研究计划(2017HH0031),四川省国际合作与交流研究计划(2018HH0016)

    分类号: S511;TS210.1

    页码: 1-9

    总页数: 9

    文件大小: 630K

    下载量: 207

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