基于高通量测序的西洋参根际土壤细菌群落分析

论文摘要

目的:研究健康西洋参和患根腐病西洋参的根际土壤细菌群落结构变化,为研究西洋参根腐病的发生机制及其调控技术提供依据。方法:以未种过西洋参的土壤(C组)、新茬地4年生健康参根际土壤(N组)、新茬地4年生根腐病参根际土壤(R组)和轮作地4年生健康参根际土壤(LN组)为研究对象,采用Illumina Miseq高通量测序技术分析了土壤细菌群落结构的变化。结果:12个土壤样品基因组经16S测序共获得有效序列695 263条,用于物种分类的OTUs 8 081个,涵盖了30门、86纲、115目、256科、464属。在属的水平上,4个组细菌群落组成及相对丰度差别很大,其中芽胞杆菌属(Bacillus)、鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)和芽单胞菌属(Gemmatimonas)可能是西洋参生长的有益菌,而假单胞菌属(Pseudomonas)和鞘脂菌属(Sphingobium)可能是引起西洋参根腐病发生的关键菌群,后续研究应重点关注。结论:健康西洋参和根腐病西洋参根际土壤及新茬地和轮作地西洋参根际土壤中微生物组成和结构均具有显著性差异,本结果对于探究西洋参根腐病发生的微生态机制和改良种植西洋参土壤微生物具有理论指导作用,为建立西洋参与主要农作物的合理轮作制度提供实验数据。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 李丽,蒋景龙

关键词: 西洋参,基因,连作障碍,微生物群落,高通量测序

来源: 中药材 2019年01期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技,基础科学,农业科技

专业: 生物学,农业基础科学,农艺学,农作物

单位: 陕西理工大学陕西省催化基础与应用重点实验室,陕西理工大学生物科学与工程学院

基金: 国家自然科学基金(31660153),陕西理工大学科研基金项目(SLGKY16-23)

分类号: S154.3;S567.53

DOI: 10.13863/j.issn1001-4454.2019.01.002

页码: 7-12

总页数: 6

文件大小: 1912K

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