大豆GmAAP基因的克隆、生物信息学分析及亚细胞定位

大豆GmAAP基因的克隆、生物信息学分析及亚细胞定位

论文摘要

本研究以大豆Williams 82为实验材料,采用RT-PCR技术克隆到了GmAAP基因,其开放阅读框长度为1440 bp,编码479个氨基酸。生物信息学分析表明,GmAAP蛋白分子量为53.286 kD,理论等电点为8.93,不稳定指数为34.04,属于稳定的蛋白结构;其二级结构中α-螺旋、β-折叠、β-转角、无规卷曲分别占据47.18%、15.66%、2.71%、34.45%;跨膜区与疏水性分析显示其含有10个跨膜区,且构成跨膜区的氨基酸多为疏水性氨基酸;GmAAP与野生大豆AAP6亲缘关系最为相近,且序列比对的一致性为100%,可能为大豆AAP6基因。构建融合表达载体,利用PEG-Ca2+介导法转化拟南芥原生质体进行亚细胞定位分析,结果显示GmAAP定位在质膜上。AAP能提高豆科植物对外源氮的吸收与利用率,进而增加种子内贮藏蛋白含量,提升大豆品质。本研究的结果可为GmAAP功能的进一步研究奠定基础,同时也为氮素的高效利用提供候选基因。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料
  •   1.2 仪器与试剂
  •   1.3 方法
  •     1.3.1 GmAAP基因的克隆
  •     1.3.2 GmAAP序列的生物信息学分析
  •     1.3.3 融合表达载体的构建
  •     1.3.4 GmAAP的亚细胞定位
  • 2 结果与分析
  •   2.1 GmAAP基因克隆与融合表达载体构建
  •   2.2 GmAAP序列的生物信息学分析
  •   2.3 GmAAP亚细胞定位
  • 3 讨论与结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 王俊皓,谢五洋,徐华祥,袁学顺,周莹,崔喜艳

    关键词: 大豆,氨基酸通透酶,基因克隆,生物信息学分析,亚细胞定位

    来源: 中国油料作物学报 2019年05期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,农作物

    单位: 吉林农业大学生命科学学院

    基金: 吉林省自然科学基金项目(主题科学家专项)(20180101026),吉林省教育厅“十三五”科学技术项目基金(JJKH20170307KJ),吉林农业大学国家级大学生创新项目(201610193047)

    分类号: Q943.2;S565.1

    DOI: 10.19802/j.issn.1007-9084.2019055

    页码: 705-712

    总页数: 8

    文件大小: 1530K

    下载量: 409

    相关论文文献

    • [1].生物信息学分析筛选胆管癌新候选基因及其意义[J]. 中国医学前沿杂志(电子版) 2020(07)
    • [2].mmu-miR-3475-3P在心脏发育中的生物信息学分析[J]. 重庆医学 2017(26)
    • [3].基于生物信息学分析结合RT-PCR检测的肝细胞癌组织中miRNA表达变化及意义[J]. 山东医药 2020(01)
    • [4].白假丝酵母菌毒力相关的RAPD条带的克隆及其生物信息学分析[J]. 生物技术 2020(01)
    • [5].生物信息学分析影响胶质母细胞瘤生物学行为的关键基因[J]. 武警医学 2020(04)
    • [6].溃疡性结肠炎及其恶性并发症的生物信息学分析和潜在治疗药物筛选[J]. 上海交通大学学报(医学版) 2020(03)
    • [7].统计学方法在生物信息学分析中的应用[J]. 医学信息学杂志 2020(06)
    • [8].弓形虫微线蛋白25的生物信息学分析及其互作蛋白预测[J]. 中国病原生物学杂志 2020(09)
    • [9].癌症疼痛基因的生物信息学分析及其临床意义[J]. 中国医药指南 2020(28)
    • [10].桃拉病毒基因组的生物信息学分析[J]. 安徽农业科学 2019(08)
    • [11].2001—2010年结直肠癌易感基因的生物信息学分析[J]. 肿瘤防治研究 2013(11)
    • [12].前列腺癌对多西他赛耐药相关基因的生物信息学分析[J]. 临床泌尿外科杂志 2020(07)
    • [13].心脏肌球蛋白结合蛋白C的生物信息学分析[J]. 生物信息学 2016(04)
    • [14].淡色库蚊氨肽酶N基因的克隆及生物信息学分析[J]. 中国人兽共患病学报 2016(03)
    • [15].鱼腥草乙酰辅酶A酰基转移酶基因克隆、表达及生物信息学分析[J]. 中草药 2015(01)
    • [16].女性糖尿病周围神经病变相关基因筛选及生物信息学分析[J]. 海南医学院学报 2020(01)
    • [17].烟草丙酮酸脱羧酶的生物信息学分析[J]. 黑龙江农业科学 2020(02)
    • [18].青岛文昌鱼过氧化氢酶基因的克隆及生物信息学分析[J]. 基因组学与应用生物学 2020(02)
    • [19].hsa-miR-216a-5p的靶基因及调控网络的生物信息学分析[J]. 唐山师范学院学报 2020(03)
    • [20].血管紧张素转化酶2生物信息学分析[J]. 安徽科技学院学报 2020(04)
    • [21].人谷胱甘肽过氧化物酶的生物信息学分析[J]. 北华大学学报(自然科学版) 2016(06)
    • [22].海岛棉一个成花素类似基因的克隆和生物信息学分析[J]. 新疆农业科学 2011(11)
    • [23].牛带绦虫亚洲亚种苹果酸脱氢酶基因的生物信息学分析[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志 2008(03)
    • [24].牛PAI-1基因真核表达载体构建、生物信息学分析及功能初探[J]. 中国畜牧杂志 2020(08)
    • [25].基于高通量芯片对小儿急性髓系白血病的生物信息学分析[J]. 吉林大学学报(医学版) 2020(05)
    • [26].沉默调节因子的生物信息学分析[J]. 黑龙江畜牧兽医 2017(09)
    • [27].转座子的分类与生物信息学分析[J]. 农技服务 2016(08)
    • [28].嗜根考克氏菌双组分信号转导系统的生物信息学分析[J]. 基因组学与应用生物学 2020(08)
    • [29].微小脲原体3-00990的生物信息学分析与原核表达[J]. 重庆医学 2020(21)
    • [30].甲状旁腺素的生物信息学分析[J]. 口腔医学研究 2011(07)

    标签:;  ;  ;  ;  ;  

    大豆GmAAP基因的克隆、生物信息学分析及亚细胞定位
    下载Doc文档

    猜你喜欢