2016年~2018年山东地区25株H9N2亚型禽流感病毒分子分析

2016年~2018年山东地区25株H9N2亚型禽流感病毒分子分析

论文摘要

H9N2亚型禽流感(AI)持续在我国鸡群中广泛流行,为了明确山东及周边养殖场H9N2亚型禽流感病毒(AIV)的分子进化情况,本研究对2016年~2018年间从山东及周边养殖场病鸡中分离鉴定得到的25株H9N2亚型AIV分别纯化后进行全基因组测序和遗传演化分析,并分析序列中重要氨基酸位点的变异情况。全基因组序列分析显示:25株H9N2 AIV 8个基因节段均属于欧亚谱系,但8个基因节段的分子进化关系呈现出基因多样性:HA、NA基因来自Y280-like,25株分离株HA基因之间的同源性为92.8%~99.9%,NA基因之间的同源性为91.0%~99.9%;PB2基因来自G9-like;PB1、PA、NP、NS基因来自F98-like;M基因来自G1-like。HA蛋白的受体结合位点149、198、234和235位点变异最多,25株分离株HA均出现Q234L突变(相当于H3第226位氨基酸);21株分离株在HA蛋白218~300位糖基化位点缺失,所有分离株均在313~315位出现潜在的糖基化位点;仅3株分离株的NA蛋白在402位出现糖基化位点,而NA蛋白在264位有11株分离株出现了潜在糖基化位点;5株分离株在PB2蛋白的627位点发生变异,1株在PB2蛋白的714位点发生变异。以上结果表明,近3年山东周边地区流行的H9N2 AIV是由不同进化方式而来,部分重要氨基酸位点出现了变异,具有潜在感染哺乳动物的可能性,因此需加强H9N2 AIV的分离鉴定,密切监测其遗传变异情况。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 主要实验材料
  •   1.2 病毒分离与鉴定
  •   1.3 病毒各基因节段的P CR扩增及克隆测序
  •   1.4 序列分析
  • 2 结果与讨论
  •   2.1 病毒的分离与鉴定
  •   2.2 8个基因节段遗传进化和关键氨基酸位点分析
  •     2.2.1 HA基因及关键位点氨基酸分析
  •     2.2.2 NA基因及关键位点氨基酸分析
  •     2.2.3 PB2、PB1、PA、NP、M、NS基因的遗传进化分析
  •     2.2.4 PB2、PB1、PA、NP、M、NS关键位点氨基酸变异分析
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 陈照坤,鲁梅,黄小莹,马鑫鑫,朱凤珠,黄庆华,古曙光,杨少华,许传田,崔宁

    关键词: 亚型禽流感病毒,分子进化,糖基化,突变,基因

    来源: 中国预防兽医学报 2019年09期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,畜牧与动物医学

    单位: 山东师范大学生命科学学院,山东省农业科学院畜牧兽医研究所/山东省畜禽疫病防治与繁育重点实验室,山东潍坊工程职业学院,山东泰安肥城市畜牧兽医局,日照市东港区西湖镇畜牧兽医站

    基金: 十三五国家重点研发计划(2016YFD0500201),山东省博士基金(ZR2017BC094),现代农业产业技术体系(CARS-41-Z10),山东省农业科学院农业科技创新工程(CXGC2016A10)

    分类号: S852.65

    页码: 958-963

    总页数: 6

    文件大小: 3685K

    下载量: 108

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